Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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