Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp38Q8BW70 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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