Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms