Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms