Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan9Q8BJU2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tspan9Q8BJU2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tspan9Q8BJU2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tspan9Q8BJU2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tspan9Q8BJU2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan9Q8BJU2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms