Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms