Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms