Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms