Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms