Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Znf516Q7TSH3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Znf516Q7TSH3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf516Q7TSH3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf516Q7TSH3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Znf516Q7TSH3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf516Q7TSH3 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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