Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms