Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms