Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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