Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms