Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms