Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sarm1Q6PDS3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms