Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms