Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms