Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms