Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms