Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4Q6P1D7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms