Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep170Q6A065 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep170Q6A065 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms