Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fgd6Q69ZL1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd6Q69ZL1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd6Q69ZL1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd6Q69ZL1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd6Q69ZL1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd6Q69ZL1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd6Q69ZL1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd6Q69ZL1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms