Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf1Q64213 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sf1Q64213 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sf1Q64213 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sf1Q64213 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sf1Q64213 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sf1Q64213 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms