Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sall3Q62255 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sall3Q62255 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms