Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sycp1Q62209 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms