Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AtrxQ61687 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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AtrxQ61687 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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