Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms