Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms