Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms