Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms