Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms