Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms