Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms