Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms