Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms