Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms