Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms