Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms