Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms