Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms