Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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