Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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