Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms