Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec11Q3SXB8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec11Q3SXB8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec11Q3SXB8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec11Q3SXB8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec11Q3SXB8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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