Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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