Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms