Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms