Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnnm1Q0GA42 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms