Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms